Una vacuna candidata al #SARSCoV2 probablemente coincidiría con todas las variantes que circulan actualmente

La rápida propagación del virus que causa COVID-19, SARS-CoV-2, plantea interrogantes sobre la posibilidad de una vacuna universalmente eficaz. El virus puede mutar en un individuo determinado y estas variantes se pueden propagar entre poblaciones y tiempos. Para comprender este proceso, analizamos 18,514 secuencias de SARS-CoV-2 muestreadas desde diciembre de 2019. Encontramos que la evolución neutra, en lugar de la selección adaptativa, puede explicar las mutaciones raras observadas en los genomas de SARS-CoV-2. En la proteína Spike inmunogénica, la mutación D614G se ha convertido en consenso, pero no hay evidencia de mutaciones que afecten la unión al receptor ACE2. Nuestros resultados sugieren que, hasta la fecha, la diversidad limitada observada en el SARS-CoV-2 no debería impedir que una sola vacuna proporcione protección global.
La magnitud de la pandemia de COVID-19 subraya la urgencia de una vacuna segura y eficaz. Muchos candidatos a vacunas se centran en la proteína Spike, ya que está dirigida por anticuerpos neutralizantes y juega un papel clave en la entrada viral. Aquí investigamos la diversidad observada en las secuencias del coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV-2) y la comparamos con la secuencia en la que se basan la mayoría de las vacunas candidatas. Utilizando 18.514 secuencias, realizamos análisis filogenéticos, genéticos de poblaciones y bioinformáticos estructurales. Encontramos una diversidad limitada en los genomas del SARS-CoV-2: sólo 11 sitios muestran polimorfismos en> 5% de las secuencias; sin embargo, dos mutaciones, incluida la mutación D614G en Spike, ya se han convertido en consenso. Debido a que el SARS-CoV-2 se transmite más rápidamente de lo que evoluciona, la población viral se está volviendo más homogénea, con una mediana de siete sustituciones de nucleótidos entre genomas. Hay evidencia de selección purificadora, pero poca evidencia de selección diversificada, con tasas de sustitución comparables entre genes estructurales y no estructurales. Finalmente, la secuencia de referencia de Wuhan-Hu-1 para la proteína Spike, que es la base de diferentes candidatos a vacunas, coincide con insertos de vacuna optimizados, siendo idéntica a una secuencia ancestral y una mutación de distancia del consenso. Si bien la rápida propagación de la mutación D614G justifica un estudio adicional, nuestros resultados indican que los eventos de deriva y cuello de botella pueden explicar la diversidad mínima encontrada entre las secuencias del SARS-CoV-2. Estos hallazgos sugieren que una única vacuna candidata debería ser eficaz contra los linajes que circulan actualmente.
REFERENCIAS:

Bethany Dearlove, et al. A SARS-CoV-2 vaccine candidate would likely match all currently circulating variants. Proceedings of the National Academy of Sciences Aug 2020, 202008281; DOI: 10.1073/pnas.2008281117

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